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玩转TargetScan

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miRNA的作用是抑制靶基因的翻译或降解mRNA,从而在翻译层面调控基因的表达。miRNA与靶基因的作用是miRNA行使其生物学功能的基础,寻找miRNA的靶基因是miRNA研究的核心内容。运用生物信息学的方法,研究者可以预测某个基因都有哪些miRNA可能与其作用,也可以预测一条miRNA都可能有哪些蛋白靶点。其中,最重要的也是最准确的生物信息学预测工具就是TargetScan。在本节,我们将用实际操作演示如何运用TargetScan进行靶基因预测,以及如何评价和筛选预测结果,供初次接触TargetScan的研究者迅速掌握该工具的核心使用方法。

 

本节公开课要点:

生物信息学寻找miRNA靶点的常用数据库
TargetScan的使用方法
——预测一个基因的所有miRNA位点
——TargetScan的评分判断和靶基因筛选
——预测一个miRNA的所有靶基因

 

主讲嘉宾

范宇博士,TIANGEN高级产品经理,获得北大工学院生物医学工程博士学位,主要负责RT-qPCR和miRNA产品线,研究方向为miRNA和癌症发生之间的关系,以第一作者的身份发表SCI论文一篇(IF=5),参与多篇10分以上的文章的研究工作。

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