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玩转miRanda和miRDB

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您可以通过以下公开课了解相关讲座内容。

除了TargetScan之外,目前网络上还有很多的预测miRNA与基因之间靶关系的数据库。这些数据库彼此之间的算法都各不相同,采用不同的数据库同时对目的miRNA或目的基因进行预测,有利于研究者更准确的找到潜在的靶点。在本节,我们将介绍另外两种常用的预测数据库——miRanda和miRDB的用法,用实际演示使研究者快速掌握这两种数据库的核心预测方式和操作。而且,这两节公开课的介绍将有助于研究者了解此类数据库预测的大体思路,从而顺利使用其他没有介绍的数据库。

 

本节公开课要点:

miRanda的使用方法
——预测一个基因的所有miRNA位点
——预测一个miRNA的所有靶基因
miRDB的使用方法
——预测一个基因的所有miRNA位点
——预测一个miRNA的所有靶基因
其他数据库展示

 

主讲嘉宾

范宇博士,TIANGEN高级产品经理,获得北大工学院生物医学工程博士学位,主要负责RT-qPCR和miRNA产品线,研究方向为miRNA和癌症发生之间的关系,以第一作者的身份发表SCI论文一篇(IF=5),参与多篇10分以上的文章的研究工作。

地址:北京市海淀区西小口路66号东升科技园(北领地)C7-3 电话:800-990-6057
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