TGuide Smart 环境微生物基因组DNA提取试剂盒(DP613/DP613-D)
TGuide Smart 环境微生物基因组DNA提取试剂盒专为土壤、粪便、污泥及水体滤膜等复杂环境样本设计,基于磁珠法并结合腐殖酸抑制物去除体系,高效去除PCR抑制物,配合 TGuide S16 / S32 Pro 自动化工作站,为 16S 测序及宏基因组学研究提供高纯度、高得率的核酸模板。
本平台上的产品仅可用于工业或者科研领域等非医疗目的的用途。
产品规格
| 目录号 | 规格 | 目录价 | 说明书 |
| DP613 | 96次 | 3608 | |
| DP613-D | 48次 | 2080 |
产品简介
DP613 环境微生物基因组 DNA 提取试剂盒 专为复杂环境样本的微生物 DNA 提取需求而设计, 适用于土壤、粪便、发酵产物、水体、池塘淤泥、海洋沉积物及肠道内容物等多种样本类型。
本试剂盒采用优化的裂解液体系,并结合高效腐殖酸助沉剂, 可有效降低环境样本中腐殖酸等 PCR 抑制物的干扰, 适用于革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌及真菌等多类微生物的基因组 DNA 提取。
配合 TGrinder H24R 低温均质仪 及专用研磨珠 使用,有助于充分破碎顽固微生物细胞壁, 从而获得完整性和得率表现良好的基因组 DNA。
通过磁珠法纯化获得的 DNA 纯度较高、杂质含量低, 可直接用于PCR、qPCR、文库构建及二代测序(NGS)等下游分子生物学实验。
特别适用于高腐殖酸、高抑制物背景下的复杂环境样本微生物基因组 DNA 提取。
样本类型
适用于多种复杂环境样本的微生物基因组 DNA 提取,包括但不限于以下类型:
- 土壤样本(Soil samples)
- 粪便样本(Feces / Stool samples)
- 发酵产物(Fermentation products)
- 水体样本(Water samples)
- 淤泥样本(Sludge)
- 海洋沉积物(Marine sediments)
- 肠道内容物(Intestinal contents)
- 生物膜(Biofilm)
产品特点
- 高效去除腐殖酸抑制物: 采用优化的腐殖酸去除技术,可在约 1 分钟内 显著降低环境样本中 PCR 抑制物的影响, 有助于提升下游扩增及测序实验的稳定性。
- DNA 纯度与完整性表现良好: 基于磁珠法纯化工艺,获得的基因组 DNA 杂质含量低、纯度高,得率好, 可直接用于 PCR、qPCR、文库构建及二代测序(NGS) 等下游应用。
- 适用于多种复杂环境样本: 针对土壤、粪便、淤泥、水体滤膜等复杂环境样本进行了流程优化, 适合多类型微生物 DNA 的提取需求。
- 兼容自动化核酸提取平台: 试剂采用预封装设计,可适配 TGuide S16 / TGuide S32 Pro 全自动核酸提取仪,并支持扩展至 TGuide S96 Dex 高通量平台。
适配仪器
试剂采用预封装设计,可适配多款 TGuide 系列全自动核酸提取平台,包括:
环境样本整体解决方案概览(环境微生物 DNA 提取)
DP613 结合优化的环境样本前处理流程与自动化核酸提取平台, 构建了一套适用于多种复杂环境样本的微生物基因组 DNA 提取解决方案。
该方案覆盖土壤、粪便、肠道内容物、水体、沉积物及淤泥等样本类型, 在保证操作简便性的同时,兼顾提取稳定性、DNA 得率及纯度表现, 适合后续 PCR、测序及微生物群落分析等应用。
方案优势
特别适用于高腐殖酸、高抑制物背景下的复杂环境样本微生物基因组 DNA 提取。
- 前处理简便: 优化的研磨与预分装体系,便于快速处理多种复杂环境样本。
- 结果稳定均一: 自动化磁珠法提取流程稳定,实验结果重复性好。
- DNA 得率表现良好: 裂解与纯化流程针对复杂样本优化,有助于提高基因组 DNA 提取得率。
- DNA 纯度高: 有效去除腐殖酸等 PCR 抑制物,获得适用于下游分析的高质量 DNA。
- 样本通用性强: 适用于土壤、粪便、肠道内容物、水体及沉积物等多种环境样本。
▶ 环境微生物整体解决方案
了解该产品对应的完整解决方案(样本前处理,DNA 提取到下游实验) →
应用场景
推荐应用于以下典型环境微生物研究场景:
- 土壤和淤泥等高腐殖酸含量的样本
- 粪便及肠道内容物等高抑制物样本
- 需要直接进行 PCR / NGS 的环境微生物研究前处理场景
FAQ
环境样本中的腐殖酸为什么会影响PCR扩增和测序结果?
环境样本中的腐殖酸、多酚类物质以及部分有机杂质,可能在DNA提取过程中与核酸共同提取出来难于分离。这些成分会影响PCR反应体系中酶的活性,导致扩增效率下降、Ct值异常,甚至影响测序文库构建质量。
因此,在环境微生物研究中,除了获得足够的DNA产量之外,降低腐殖酸等抑制物残留同样重要。DP613针对复杂环境样本设计了专门的抑制物去除流程,可帮助获得更适用于PCR、qPCR及NGS分析的DNA模板。
提取获得的DNA可以直接用于16S测序和宏基因组测序吗?
可以。
环境微生物研究对DNA纯度和完整性具有较高要求。提取得到的DNA如果存在较多抑制物残留,可能影响扩增和建库效果。
经过大量客户端实验证实,DP613提取获得的微生物基因组DNA可用于16S rRNA扩增子测序、宏基因组测序、PCR及qPCR等常见研究场景。对于高腐殖酸背景样本,建议结合浓度、纯度和完整性检测结果评价样本质量后再进行下游实验。
为什么环境样本DNA提取通常比纯培养菌提取更困难?
纯培养菌样本组成相对简单,而环境样本往往同时含有微生物细胞、无机颗粒,各类有机杂质等各种抑制物。
在提取过程中,不仅需要充分裂解不同类型微生物的细胞壁,做到尽量均一裂解,还需要尽可能降低腐殖酸等各类杂质的干扰。因此,环境样本DNA提取对裂解效率和纯化能力通常提出更高要求。
土壤、粪便和污水样本为什么可以采用相似的DNA提取策略?
虽然这些样本来源不同,但都具有微生物组成复杂、杂质含量高以及可能存在PCR抑制物的特点。
因此,在DNA提取过程中,通常都需要经历充分裂解、抑制物去除和核酸纯化等关键步骤。DP613针对这类复杂环境样本进行了优化,可用于土壤、粪便、肠道内容物、污泥、水体滤膜以及沉积物等样本类型的微生物DNA提取。
自动化磁珠法为什么越来越多地应用于环境微生物研究?
随着微生物组学研究样本量不断增加,实验室对于提取效率和结果一致性的要求也越来越高。
与传统离心柱法相比,自动化磁珠法能够减少人工操作步骤,降低交叉污染风险,并提高批量样本处理能力,提高样本间的提取效果的稳定性和均一性。因此,在土壤微生物组研究、环境监测、16S测序及宏基因组项目中,自动化提取已逐渐成为常见的样本处理方式。
哪些研究场景适合使用环境微生物DNA提取试剂盒?
环境微生物DNA提取通常应用于微生物群落结构分析、16S rRNA扩增子测序、宏基因组学研究、环境监测以及生态系统研究等场景。
可用于提取土壤、沉积物、污泥、粪便,肠道内容物,发酵物菌泥和水体滤膜,空气滤膜等复杂样本,获得高质量的DNA并可以用于下游各类检测实验。


